雲(yun) 計算是一種通過Internet以服務的方式提供動態可伸縮的虛擬化的資源的計算模式。現今,隨著高通量測序技術的迅猛發展,生物信息學進入到大數據時代,所引發的多組學海量生物數據的存儲(chu) 和分析等問題亟待需要利用雲(yun) 的方式來解決(jue) 。
近期,中國科學院北京基因組研究所基因組科學與(yu) 信息重點實驗室的“百人計劃”章張研究員,與(yu) 沙特阿卜杜拉國王科技大學(King Abdullah University of Science and Technology)、北京理工大學、IBM中國係統與(yu) 科技中心開展合作研究,在Biology Direct雜誌上發表了題為(wei) Bioinformatics clouds for big data manipulation的學術論文。文中分析了現有生物信息學領域的雲(yun) 計算服務(簡稱:生物信息雲(yun) ),根據其服務特點提出分類方法:數據即服務(DaaS,Data as a Service)、軟件即服務(SaaS,Software as a Service)、平台即服務(PaaS,Platform as a Service)以及基礎設施即服務(IaaS,Infrastructure as a Service)。
生物信息雲(yun) 從(cong) 四個(ge) 方麵提供了海量生物數據的儲(chu) 存、獲取、分析等相關(guan) 需求的服務。同時,文中對雲(yun) 計算在生物信息學的應用進行了展望和討論,提出並分析了以下幾個(ge) 亟需解決(jue) 問題,即生物信息雲(yun) 應實現數據和軟件的雲(yun) 儲(chu) 存,結合的高速傳(chuan) 輸、P2P、數據壓縮等大數據的傳(chuan) 輸,開發基於(yu) 雲(yun) 的輕量型編程環境,以及建立開放的生物信息學雲(yun) 平台。